研究团队利用质谱、基因组学和生物信息学进一步探索Alkbh5 敲除小鼠精子发生异常的深层原因。首先,通过质谱技术检测发现Alkbh5 敲除小鼠睾丸总mRNA 及相关RNA 的m6A 甲基化水平升高(图5.2A)。精子发生是一个高度复杂且受到多种因素...[继续阅读]
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研究团队利用质谱、基因组学和生物信息学进一步探索Alkbh5 敲除小鼠精子发生异常的深层原因。首先,通过质谱技术检测发现Alkbh5 敲除小鼠睾丸总mRNA 及相关RNA 的m6A 甲基化水平升高(图5.2A)。精子发生是一个高度复杂且受到多种因素...[继续阅读]
[1]Chen T, Hao Y J, Zhang Y, et al. m6A RNA methylation is regulated by micro RNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell, 2015, 16(3):289-301.[2]Geula S, Moshitch-Moshkovitz S, Dominissini D, et al. m6A mRNA methylation facilitates re...[继续阅读]
已有研究发现,SRSF3 和SRSF10 定位于富集剪接因子的核斑点[20],并且m6A 核内结合蛋白YTHDC1 定位于与核斑点毗连的YT 小体上[12]。作者团队利用RNase A 降解RNA,发现RNA 降解后,YTHDC1、SRSF3 和SRSF10 在细胞核内的信号都消失了,这表明这三个蛋白...[继续阅读]
这种突变miRNA诱导从头生成m6A修饰的现象使得研究者推测miRNA可能调控METTL3 和mRNA 之间的相互作用。为了验证这种假设,周琪团队和作者团队首先检测了DICER 对METTL3 胞内定位的影响。已有研究报道,METTL3 定位在核斑点并在其内发挥功能...[继续阅读]
研究团队发现P7 条件性敲除小鼠小脑中m6A 修饰水平下降的基因中包括与小脑发育以及神经凋亡相关的基因,比如与小脑发育相关的基因Atoh1、Cxcr4、Notch2 和配体Jag1,与神经凋亡相关的基因Dapk1、Fadd 和Ngfr(图6.5A)。之后,进一步通过放线...[继续阅读]
为了从FDA 认证过的药物中发现潜在的FTO 抑制剂,黄牛团队采用自主开发的基于化合物结构的虚拟分层筛选方法对化合物库进行筛选(图8.1A)[32-36],发现恩他卡朋——一种儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)的抑制剂并用于帕金森疾病治疗的辅助药...[继续阅读]
ALYREF 是出核复合体TREX 的组成蛋白,它在介导mRNA 出核的过程中具有重要调控作用[22]。作者团队通过免疫荧光实验,发现ALYREF 的核质定位受到NSUN2 的调控,当敲低NSUN2 时,ALYREF 在核斑点的定位信号显著增加(图3.11A;P...[继续阅读]
气温升高是全球气候变化的重要趋势,对农作物生产造成严重威胁。水稻的正常生长温度范围为13.5~35.4℃[25]。超过最低或最高温度时,植株的生长将受到抑制。超过致死温度(42.9℃)时,将发生不可逆的组织损伤[25,26]。植物细胞中已经...[继续阅读]
[1]Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, et al. Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq. Nature, 2012, 485(7397):201-206.[2]Wang X, Zhao B S, Roundtree I A, et al. N6-methyladenosine modulates messenger RNA trans...[继续阅读]
随后,利用PAR-CLIP 技术结合RNA 体外生物素标记实验,发现敲低YTHDF1 之后,YTHDF3 结合RNA的能力显著升高(图3.7E)。有趣的是,敲低YTHDF3 之后,YTHDF1 结合RNA的能力也显著升高(图3.7F),这表明两个蛋白能相互调控各自的RNA结合能力。通过PAR-CLIP...[继续阅读]