为了鉴定水稻中mRNA m5C 甲基转移酶,种康团队在水稻基因组注释数据库(RAP-DB)中对人mRNA m5C 甲基转移酶NSUN2[6]的氨基酸序列进行了序列同源比对,在水稻中鉴定到8 个NSUN RNA 甲基转移酶家族成员,命名为OsNSUN1(Os08g0484400)、OsNSUN2(Os09g047190...[继续阅读]

    脊椎动物的造血干细胞由生血内皮细胞通过EHT 定向分化而来[16-18]。已有研究表明,m6A 参与调控胚胎干细胞的命运决定过程[4,19],然而其在多能干细胞命运决定过程中的作用和分子机制仍不清楚。刘峰团队和汪海林团队合作,通过UHPL...[继续阅读]

    [1]Jia G, Fu Y, He C. Reversible RNA adenosine methylation in biological regulation.Trends Genet, 2013, 29(2): 108-115.[2]Niu Y, Zhao X, Wu Y S, et al. N6-methyl-adenosine(m6A)in RNA: an old modification with a novel epigenetic function. Genomics Proteomi...[继续阅读]

    先前的研究发现,m6A 细胞质结合蛋白Ythdf2 通过识别mRNA 上的m6A 修饰位点,引导靶基因至细胞质中的P 小体(P body)导致其降解,调控细胞质中mRNA 的含量[4]。刘峰团队和作者团队通过敲低ythdf2,得到了与mettl3 敲低组胚胎一致的表型。敲低...[继续阅读]

    斑马鱼的造血过程可以分为初级造血和次级造血两个阶段。初级造血是一个短暂的过程,能够为早期胚胎提供必需的营养和免疫防御,此后初级造血会被次级造血所替代。次级造血过程起始于主动脉-性腺-中肾区域(aorta-gonad-mesonephros...[继续阅读]

    m6A 被发现存在于所有高等真核生物mRNA 和病毒RNA 中[16-19]。为检测mRNA 上m6A 是否为FTO 的生理底物,何川团队分别对HeLa 细胞和293FT 细胞进行FTO 特异性敲低处理48 小时,以siRNA 处理的细胞作为对照。对不同处理的细胞采用生物素-多聚T...[继续阅读]

    m6A 调控蛋白在多种癌症中的重要作用提示它们可以被视为癌症治疗的潜在靶点[67]。比如,鉴于FTO 在白血病和恶性胶质瘤中的重要功能[20,21,23],可能通过靶向FTO 来治疗这类癌症。的确,多种FTO 的小分子抑制剂已经被用来抑制FTO 的催化...[继续阅读]

    AlkB 家族中已鉴定出9 个同源蛋白,其中FTO 是第一个被发现的RNAm6A 去甲基化酶。那么AlkB 家族蛋白中除了FTO 以外,是否还有其他的RNA 去甲基化酶呢? 为了回答这一问题,何川团队在体外表达大肠杆菌AlkB 人同源基因的重组蛋白,然后用生...[继续阅读]

    鉴于FTO 在肥胖以及m6A 修饰去甲基化中的重要作用,当前针对其抑制剂的开发有了一定的进展。这些抑制剂按照类型主要可以分为大黄酸(rhein)、甲氯芬那酸(MA)、FB23 和FB23- 2 以及α 酮戊二酸(2OG)类似物等。大黄酸在中药中为芦荟和大黄...[继续阅读]

    为鉴定ALYREF 识别m5C 的蛋白结构域,作者团队参考DNA 上5mC 的结合蛋白MBD 家族和RNA m6A 结合蛋白YTH 家族,将其序列与ALYREF蛋白序列进行比对,筛选出9 个潜在影响结合的关键氨基酸位点(图3.10A),并构建了9 个位点突变的ALYREF 蛋白。随后,通...[继续阅读]