红树植物木榄SCoT-PCR体系优化及遗传多样性分析

摘要： 为优化建立木榄的SCo T-PCR体系,利用建立的SCo T方法进行分析木榄不同地理种源的遗传多样性,基于L25(56)正交设计,本研究在5个水平上优化试验了5个影响木榄SCo T-PCR的因素:模板DNA、Mg~(2+)、d NTPs、Taq酶和引物。同时,运用优化的SCo T体系对木榄8个不同地理种源进行遗传多样性分析。本研究结果建立了木榄SCo T-PCR最佳反应体系(20μL):模板DNA 20 ng,引物0.75μmol/L,d NTPs 0.5 mmol/L,Mg~(2+)2.5 mmol/L,Taq酶1.25 U。同时,筛选出了带谱清晰、多态性丰富的16条SCo T引物进行遗传多样性分析。共扩增出115个位点,其中73个为多态性位点,多态性比例为62.33%。从UPGMA聚类和PCo A分析结果可以看出8个地理种源间的遗传多样性及亲缘关系。研究表明SCo T分子标记可以用于木榄种群的遗传多样性。 （共10页）