鸡白痢沙门菌spiC基因克隆与生物信息学分析

摘要： 为了研究鸡白痢沙门菌SpiC蛋白的功能,以鸡白痢沙门菌S06004基因组DNA为模板PCR扩增spiC基因,进行克隆测序和生物信息学分析,并调查该基因在255株不同年代鸡白痢沙门菌分离株中的分布与进化情况。结果显示,鸡白痢沙门菌spiC基因全长384bp,编码127个氨基酸,在不同年代分离株中稳定存在。推导SpiC蛋白无跨膜区、信号肽和卷曲螺旋结构,有1处酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,2处N-豆蔻酰化位点,预测线性抗原表位主要分布在15-20、29-35、52-53、70-72、83-85、89-94aa。利用SWISS MODEL在线程序建模,得到SpiC三维结构模型。同源性及进化分析显示spiC基因仅存在于沙门菌中且比较保守,鸡白痢沙门菌SpiC蛋白与沙门菌肠道亚种亲缘关系最近。 （共5页）